司空見慣的植物中,隱藏著無數(shù)基因“秘密”。最近,我國各地的科研人員,又分別破解了3個。3項成果來自的院校不同、植物不同,相同的是,皆為相關(guān)領(lǐng)域突破性進展。
破譯甘蔗基因組讓“甜蜜事業(yè)”變得更甜
“我們這項研究將指導(dǎo)甘蔗育種改良、增加含糖量,讓‘甜蜜事業(yè)’變得更甜?!备=ㄞr(nóng)林大學(xué)明瑞光教授在回答科技日報記者提問時表示。此前,甘蔗品種單一化問題嚴重,依靠擴大種植面積等傳統(tǒng)生產(chǎn)方式難以維系。
國內(nèi)甘蔗研究“重鎮(zhèn)”福建農(nóng)林大學(xué)宣布,該校明瑞光教授團隊在國際上首次破譯甘蔗基因組,這是全球首個組裝到染色體水平的同源多倍體基因組,標(biāo)志著全球農(nóng)作物基礎(chǔ)生物學(xué)研究取得重大突破。該成果于8日在國際頂級學(xué)術(shù)期刊《自然·遺傳學(xué)》上在線發(fā)表。
C4光合途徑普遍被認為是高效的光合模式,甘蔗作為全球最重要的糖能作物,近年來,巴西、法國等國都在積極開展甘蔗基因組研究,但由于甘蔗是基因組最為復(fù)雜的作物之一,又受到高多倍體和同源異源雜交品種等因素限制,均未獲得突破性進展。
該研究在全世界首次破譯甘蔗基因組的基礎(chǔ)上,從甘蔗的高糖、高光合等生物學(xué)遺傳特征為著手點,首次在甘蔗野生種“割手密”基因組中發(fā)現(xiàn)了富集抗性基因的重組區(qū)域,闡明了“割手密”作為甘蔗育種抗原的生物學(xué)基礎(chǔ),為甘蔗分子育種提供理論支持,對全球甘蔗的遺傳改良具有里程碑貢獻,從而加快甘蔗品種改良和產(chǎn)業(yè)發(fā)展,將產(chǎn)生顯著的經(jīng)濟效益和社會效益。
“神秘基因”可讓菊花少吃氮
作為中國十大傳統(tǒng)名花和世界四大鮮切花之一,起源于中國的菊花遍布世界各地,其栽培面積和產(chǎn)量均位居各種花卉前列。但很多人不知道,根系發(fā)達的“喜肥植物”菊花在生長期尤其喜歡“吃氮肥”,由此造成氮肥使用過度,污染土地。有沒有新品種可“少用氮肥,就可養(yǎng)活”?
近日,Nature子刊《園藝研究》在線發(fā)表了山東農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝科學(xué)與工程學(xué)院胡大剛、鄭成淑教授和孫翠慧老師的研究成果“菊花MADS-box轉(zhuǎn)錄因子CmANR1調(diào)控生長素極性運輸基因介導(dǎo)菊花根系的發(fā)育”,他們在菊花根系中發(fā)現(xiàn)了一種之前并不為外界知曉的“神秘基因”,后者對菊花根系吸收氮素具有強力影響,從而為培育菊花新品種提供了理論支撐。
胡大剛團隊研究發(fā)現(xiàn),氮素尤其是硝態(tài)氮可作為信號物質(zhì)對植物根系發(fā)育起到復(fù)雜而精細的調(diào)節(jié)作用,而MADS-box轉(zhuǎn)錄因子CmANR1能夠響應(yīng)較高濃度的硝態(tài)氮?;谝幌盗醒芯浚嘤叩乩寐兽D(zhuǎn)基因菊花新品種成為可能。
植物體內(nèi)神秘“剪刀手”如何“咔咔咔”
可變剪接是生物體內(nèi)普遍存在的現(xiàn)象,就像是生物體內(nèi)一位神秘的“設(shè)計師”,會對蛋白質(zhì)進行“裁剪”,從而導(dǎo)致生物的多樣性。國際植物學(xué)權(quán)威期刊《The Plant Cell》近期在線發(fā)表了南京農(nóng)業(yè)大學(xué)鄭錄慶教授課題組的研究成果,揭示了可變剪接在植物礦質(zhì)元素代謝中的調(diào)控作用,可以控制植物營養(yǎng)元素的吸收和轉(zhuǎn)運。
在外界環(huán)境發(fā)生重大變化時,尤其是當(dāng)缺少某種植物生長必需的礦物元素時,植物體內(nèi)部就會自動發(fā)起一個響應(yīng)機制,可變剪接這位“設(shè)計師”變身“營養(yǎng)師”,對植物體內(nèi)的基因進行重新設(shè)定,使它們更加適應(yīng)環(huán)境的變化。
為了弄清可變剪接在這一過程中所起的作用,該研究首先對不同礦質(zhì)元素缺乏條件下的水稻RNA-Seq數(shù)據(jù)進行了系統(tǒng)的生物信息學(xué)分析,觀察發(fā)生可變剪接的基因是否調(diào)控了水稻體內(nèi)的礦質(zhì)元素吸收代謝。
鄭錄慶介紹:“植物對不同礦質(zhì)元素的吸收和轉(zhuǎn)運的方式途徑已有過大量的報道和研究,然而面對水稻這種模式植物體內(nèi)的缺素響應(yīng)機制,仍有大量未知的途徑亟待我們的探尋?!痹撗芯拷⒘诉m用于分析模式作物水稻的可變剪接的系統(tǒng)分析方法,拓寬了人們對植物響應(yīng)非生物脅迫過程的認知,為今后培育營養(yǎng)元素高效利用品種提供了理論依據(jù)。(謝開飛 王延斌 張 曄)